تولیت آستان قدس رضوی طی پیامی درگذشت آیت الله واعظ زاده خراسانی را به رهبری معظم انقلاب، مردم شریف ایران اسلامی و شاگردان و ارادتمندان این عالم عظیم الشان شیعه، تسلیت گفت. در این پیام آمده است:
اِنَّا للّه وإِنّا إِلَیهِ رَاجِعُونَ
قال رسول‌الله (صل الله علیه و آله و سلم): وَ إِذَا مَاتَ اْعَالِمُ الفقیه ثُلِمَ فِی الْإَسْلَامِ ثُلْمَةٌ لَا یَسُدُّهَا شَیْءٌ
خبر درگذشت عالم وارسته، فقیه والامقام و مفسر عظیم الشان قرآن کریم حضرت آیت‌الله حاج شیخ محمد واعظ زاده خراسانی (رحمت‌الله علیه) موجب تألم و تأثر گردید.
اینجانب فقدان این فقید سعید که عمر بابرکتش را در راه ترویج فرهنگ ولایت با رویکرد تقریب مذاهب اسلامی در دوران قبل و بعد از انقلاب اسلامی سپری نمود، به محضر مبارک رهبر معظم انقلاب اسلامی (مدظله العالی)، حوزه‌های علمیه، مجامع علمی و دانشگاهی و همچنین شاگردان و ارادتمندان آن عالم فرزانه تسلیت می‌گویم.
بی‌شک حوزه‌های علمیه و شخصیت‌های علمی و انقلابی قدردان زحمات آن عالم بزرگ خستگی‌ناپذیر خواهند بود، که با تالیف کتب متعدد در علوم اسلامی و فقه اهل بیت (علیهم‌السلام) و ترویج فرهنگ تقریب از جمله تالیف کتاب وزین «المعجم فی فقه لغه القرآن و سر بلاغته» به رشته تحریر درآورده است.
مراکز علمی مانند دانشگاه مذاهب اسلامی و مجمع جهانی تقریب مذاهب اسلامی که آن مرحوم بنیانگذارش بوده‌اند به‌عنوان باقیات الصالحات عمر با برکتش باقی خواهند ماند و سالیان سال فرهیختگان و دانش‌پژوهان بر سر سفره تأالیفات آن فقید سعید متنعم خواهند گشت.
خدمات ایشان در آستان قدس رضوی با عضویت در شورای عالی فرهنگی این آستان و مسئولیت ایشان در بنیاد پژوهش‌های اسلامی و دانشگاه علوم اسلامی رضوی برگ زرینی از خدمات خالصانه این عالم بزرگوار به بارگاه منور رضوی است.
امیدوارم خداوند متعال آن عالم فقید را در جوار مضجع شریف حضرت ثامن‌الحجج (علیه آلآف التحیه و الثناء) مشمول الطاف و عنایات خاصه‌اش بگرداند و به بیت مکرم و فرزندان آن مرحوم صبر و اجر جزیل و جمیل عنایت بفرماید.